使用前处理：
1. 将透析袋剪成适当长度（10－20cm）的小段。
2. 在大体积的2%(W/V)碳酸氢钠和1mmol/L EDTA溶液中将透析袋煮沸10分钟。
3. 用蒸馏水彻底清洗透析袋。
4. 放在1mmol/L EDTA（PH 8.0）中将透析袋煮沸10分钟。
5. 冷却后，存放于4度，必须确保透析袋始终浸没在溶液内。
6. 用前在透析袋内装满水然后排出，将之清洗干净。

透析：
1. 用透析袋夹夹紧一端，由另一端灌满水，用手指稍微加压，检查不漏，方可装入待透析样品液。
2. 为了加快透析速度，可以多次更换透析液，还可使用磁力搅拌器搅拌。透析的容器要大一些，可以使用大烧杯、大量筒和塑料桶。
3. 一般在2-8℃条件下透析。
4. 使用透析液pH值范围5-9时透析袋可以重复使用。使用pH2-5和pH9-12等极限pH条件时透析袋一次性使用。

使用后保存：
使用后的透析袋洗净后可存于4℃蒸馏水中。
若长时间不用，可加少量NaN2，以防长菌。
再次使用的透析袋弯折时易裂口，用时必须仔细检查，不漏时才可重复使用。